Digimon Tamers terjadi di dunia di mana waralaba Digimon yang populer sangat digemari, terdiri dari kartun, video game, dan permainan kartu perdagangan. Takato Matsuda adalah penggemar Digimon yang sangat terobsesi dengan permainan kartu, dan terus melamun tentang alam semesta di dalamnya. Suatu hari, dia menemukan kartu biru misterius, yang dia geser melalui mainan pemindai untuk digunakan dalam permainan pertempuran populer. Mainannya tiba-tiba bersinar dan berubah menjadi Digivice, dan desain buatan kipas Takato, Guilmon, muncul di depannya. Terkejut oleh prospek memiliki Digimon kehidupan nyata, Takato merangkul mitra barunya, dan petualangannya sebagai penjinak Digimon dimulai. Takato dengan cepat menemukan bahwa menjadi Digimon Tamer tidak semuanya menyenangkan dan permainan — pada kenyataannya, itu jauh lebih berbahaya daripada permainan kartu yang biasa dia lakukan. Wild Digimon telah mulai muncul di seluruh Jepang, menyebabkan amukan yang mengakibatkan kekacauan dan kekacauan. Berbekal Digivice-nya, yang dapat memindai kartu perdagangan untuk memperkuat Guilmon, Takato dan mitra barunya berangkat untuk memerangi Digimon yang jahat. Mereka bertugas melindungi dunia dari serangan Digimon, sementara organisasi misterius bertekad untuk menghilangkan semua Digimon dan para Tamers mereka bersembunyi di bayang-bayang …