My Crossdressing Senpai – Makoto Hanaoka, siswi tahun kedua yang berjenis kelamin perempuan, dengan mudah menarik perhatian orang lain. Siswa tahun pertama Saki Aoi tidak terkecuali, dan dia jatuh cinta pada Makoto pada pandangan pertama. Memiliki kepribadian yang bersemangat dan penuh semangat, dia tidak segan-segan mengungkapkan perasaannya kepada seniornya. Namun, Makoto berbeda secara signifikan dari orang yang Saki anggap: Makoto bukanlah perempuan, melainkan laki-laki yang berpenampilan silang!